تعیین خصوصیات مولکولی تعدادی از جدایه های ایرانی ویروس v سیب زمینی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی
- نویسنده سکینه مرادی
- استاد راهنما حسین معصومی جهانگیر حیدرنژاد
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1392
چکیده
ویروس v سیب زمینی (pvv) از جنس پوتی ویروس بوده و یکی از سه پوتی ویروس مهم آلوده کننده سیب زمینی در اروپا می باشد، اما مطالعات مولکولی کمی بر روی این ویروس انجام گردیده است. علی رغم کشت وسیع رقم های سیب زمینی در ایران، ارزیابی مشخصی نسبت به آلودگی ارقام مختلف به pvv انجام نگردیده است. به منظور شناسایی، تعیین پراکنش و برخی از مشخصات مولکولی جدایه های ایرانی این ویروس، طی فصول زراعی سال های1389 لغایت 1391 از مزارع سیب زمینی استان های کرمان، هرمزگان، اصفهان، فارس، همدان، اردبیل، آذربایجان شرقی، آذربایجان غربی و خراسان شمالی تعداد 1189 نمونه گیاهی دارای علائم ویروسی نمونه برداری به عمل آمد. جهت تشخیص آلودگی ویروسی نسبت به pvv از آزمون ساندویچ دو طرفه الایزا استفاده گردید. نتایج به دست آمده از این آزمون بیانگر گسترش بسیار محدود ویروس در ارقام مختلف سیب زمینی به جز رقم بومی زردی در استان کرمان می باشد. به نحوی که از میان 181 نمونه گیاه سیب زمینی رقم زردی جمع آوری شده از منطقه دشت خاک شهرستان زرند تعداد 26 نمونه آلودگی به pvv را نشان دادند. علائم pvv برروی این رقم بومی به صورت تاولی شدن سطح برگها و موزائیک شدید بود. دلیل این آلودگی بالا نسبت به pvv در این منطقه می تواند کشت رقم بومی زردی و حساسیت بالای این رقم به pvvباشد. به منظور مطالعات مولکولی وتعیین جایگاه تکاملی جدایه های ایرانیpvv چهار جدایه از این ویروس انتخاب و آر ان ای کل از گیاه آلوده جداسازی و مورد مطالعات مولکولی قرار گرفت. بر پایه دندروگرام رسم شده جدایه-های مورد بررسی در سه گروه فیلوژنتیکی قرار گرفته که گروه i شامل جدایه های گزارش شده از کشورهای اروپایی و گروه iii شامل دو جدایه از کشور پرو می باشد. تمامی جدایه-های ایرانیpvv از دیگر جدایه های گزارش شده در دنیا مجزا گشته و گروه فیلوژنتیکیii را تشکیل دادند. همچنین بر پایه درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس توالی ژن p1 جدایه ایرانیker.lal.p و دیگر جدایه های موجود در بانک ژن، جدایه هایpvv به دو گروه اصلیi و ii تقسیم می گردند در گروه ii فقط جدایه هایpa1.1 و pa1.0 از کشور پرو قرار می گیرند، که از جدایه های اروپایی گروه i مجزا می گردند. جدایه ایرانی ker.lal.p نیز از دیگر جدایه های موجود مجزا می گردد. با توجه به نتایج بدست آمده جدایه های اروپایی و پرو pvv بر پایه بررسی هر کدام از ژن هایcp و p1 در دو گروه مجزا قرار می گیرند و جدایه-های ایرانی نیز از دیگر جدایه ها مجزا می گردند. این گروه بندی جغرافیایی بیانگر آن است، که جابجایی های بین قاره ای مواد گیاهی یا ناقلین ویروسی آلوده به pvv اهمیت زیادی در گسترش این ویروس در سراسر جهان نداشته است. نتایج این بررسی بیانگر آنست که pvv دارای انتشار محدودی در ارقام تجاری سیب زمینی در مزارع ایران می باشد. با این وجود، یک رقم محلی با آلودگی بالا نسبت به pvv ردیابی گردید. دلیل آلودگی پائین ارقام تجاری سیب زمینی به pvv در ایران احتمالا می تواند وجود ژن های مقاوم علیه این ویروس و عدم وجود این ژن ها در رقم بومی زردی و در نتیجه آلودگی بالای این رقم باشد، که این موضوع نیاز به بررسی های بیشتر و تکمیلی دارد.
منابع مشابه
بررسی خصوصیات بیولوژیکی و مولکولی جدایه ایرانی ویروس v سیب زمینی
ویروس v سیب زمینی ( pvv ) potato virus v ازخانواده پوتی ویریده وجنس پوتی ویروس می باشد. پیکره های آن شامل یک کپسید باتقارن شش وجهی و رشته ای خمش پذیر با طول 760 نانومتر است. ویروس v سیب زمینی دارای ژنوم rna تک لا، مثبت وتک رشته ای که حاوی9851 نوکلئوتید می باشد. ژنوم این ویروس دارای یک قاب خواندنی بزرگ (orf) بوده، که قسمت های اصلی ژنوم آن به ترتیب عبارتند از 1-viral protein genome (vpg) که درتما...
15 صفحه اولبررسی خصوصیات بیولوژیکی و مولکولی دو جدایه ویروس ایکس سیب زمینی در استان همدان
به منظور تعیین پراکنش ویروس ایکس سیبزمینی طی سال های 1389 و 1390، از مناطق کشت اصلی سیب زمینی در استان همدان شامل بهار، رزن و کبودرآهنگ بازدید و مجموعاً 456 نمونه برگی (تعداد 132 و 324 نمونه به ترتیب علائمدار و تصادفی) از 9 مزرعه جمع آوری شد. نتایج آزمون الایزا نشان دهنده آلودگی 42 نمونه تصادفی با ویروس ایکس سیب زمینی بود. میزان وقوع آلودگی به این ویروس به ترتیب کاهش در مناطق بهار (3/18%)، رزن...
متن کاملدامنه میزبانی و برخی مشخصات مولکولی تعدادی از جدایه های ویروس موزائیک یونجه در استان کرمان
ویروس موزائیک یونجه (Alfalfa mosaic virus, AlMV) یکی از مهم ترین ویروس های یونجه در سرتاسر دنیاست. به منظور مطالعه جدایه های این ویروس در استان کرمان، در طی سالهای 1386 تا 1387 از 514 بوته یونجه با علائم موزائیک، زردی، تاولی شدن سطوح برگ ها، بدشکلی و پیچیدگی و 66 بوته سیب زمینی با علائم زرد ابلقی (Calico)، در شهرستان های مختلف استان کرمان نمونه برداری به عمل آمد. آلودگی نمونه های فوق به AlMV با...
متن کاملردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ژن پروتئین پوششی سه جدایه ایرانی ویروس آبله آلو (Plum pox virus)
ویروس آبله آلو (Plum pox virus, PPV) یکی از خسارتزاترین ویروسهای درختان میوه هستهدار در دنیا می باشد. به منظور ردیابی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایههایایرانی PPV، طی سالهای زراعی 93-91، تعداد 130 نمونه برگی درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغات درختان هسته دار استانهای اردبیل ، مازندران و تهران جمعآوری شدند. ردیابی ویروس با روشهای ELISA DAS-، ایمونوبلات و همچنین RT-PCR با آغازگرهای ا...
متن کاملخصوصیات بیولوژیکی و مولکولی چند جدایه ایرانی ویروس توتهای رگبرگ مرکبات (CVEV)
ویروس توتهی رگبرگ مرکبات (Citrus vein enation virus, CVEV) گونه احتمالی جنس Enamovirus، با علائم رگبرگ توتهای و گال چوبی در تنه، اخیرا از مرکبات ایران گزارش شده است. در تحقیق حاضر خصوصیات بیولوژیکی و مولکولی تعدادی از جدایه های ویروس مطالعه شد. پس از انتقال پیوندی 29 جدایه مختلف ویروس به سه گونه میزبان شامل نارنج (Citrus aurantium)، لیموی ولکامریانا ((C. volkameriana</em...
متن کاملتعیین فراوانی، خصوصیات بیولوژیکی و جایگاه تبارزایی جدایه های ویروس A سیب زمینی بر اساس توالی ژن پروتئین پوششی در دو استان خراسان رضوی و مرکزی
و ویروس A سیبزمینی (PVA) از جمله ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. در بهار وتابستان 1389، تعددا 280 و463 نمونه برگی بهترتیب علائمدار و تصادفی و نیز تعداد 1336 غده از مزارع سیبزمینی استانهای خراسان رضوی و مرکزی جمعآوری وکل نمونهها با استفاده از آزمون الایزا از نظر آلودگی به ویروس PVA مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصل بیانگر گسترش آلودگی به این ویروس در 39 و 10 درصد نمونههای ع...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023